Dans le Plan stratégique 2019-2023, Elhuyar vise à être une organisation plus verte. À cet égard, il a travaillé pour améliorer l'efficacité énergétique du bâtiment et ainsi réduire son empreinte carbone. Les deux œuvres principales ont consisté à améliorer l'isolement du bâtiment et à faire un pas en avant dans la souveraineté énergétique avec l'utilisation de l'énergie solaire, par une installation d'autoconsommation. Pour cela, il a compté sur la collaboration de la coopérative Goiener, dont il est partenaire Elhuyar, relation qui s'est consolidée ces dernières années. D'une part, Goiener a offert un soutien à Elhuyar pour améliorer l'efficacité énergétique et, d'autre part, Elhuyar a partagé avec Goiener ses connaissances dans les domaines du basque et de la participation citoyenne, tout en incorporant une approche pour améliorer l'efficacité énergétique dans la divulgation scientifique.

Sur le chemin de la réalisation d'une entité plus verte, Elhuyar a placé 126 panneaux solaires sur le pont de son siège principal, avec lesquels il a couvert une surface de 252 m2. Ces plaques foltovoltaïques, de 47 kW de puissance, produiront 35 % de l'énergie annuelle consommée par Elhuyar, et 31 % seront un excédent énergétique qui sera incorporé au réseau. Cette installation évitera l'émission de près de 17 tonnes de CO2 par an. Le CO2 absorbé par an sera équivalent à celui absorbé par 1882 arbres. Le projet d'installation d'autoconsommation a été réalisé par la coopérative Nafarkoop du groupe Goiener.

En plus de l'installation de panneaux solaires, des travaux d'amélioration du bâtiment ont été réalisés, tant d'isolement que d'aspect, lui donnant une image plus moderne dans le contexte du 50e anniversaire. Ainsi, la façade a été réhabilitée et isolée, la couverture a été isolée et les fenêtres ont été changées. Ces travaux d'amélioration visent à réduire de 24 % les dépenses énergétiques annuelles du bâtiment et de 16,8 % les émissions annuelles de CO2.

Dans cette stratégie a également été misé sur le véhicule électrique, avec l'installation de deux points de recharge dans le bâtiment et le saut à l'utilisation de véhicules hybrides plug-in.

Pour réaliser ces travaux, 260.000 euros ont été investis, 31 % subventionnés par l'Entité basque de l'énergie.